Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HARS2P49590 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HARS2P49590 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HARS2P49590 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HARS2P49590 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HARS2P49590 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HARS2P49590 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HARS2P49590 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HARS2P49590 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms