Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC34P49427 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC34P49427 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC34P49427 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC34P49427 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CDC34P49427 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDC34P49427 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDC34P49427 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDC34P49427 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC34P49427 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC34P49427 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC34P49427 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC34P49427 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC34P49427 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC34P49427 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC34P49427 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDC34P49427 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC34P49427 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC34P49427 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC34P49427 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC34P49427 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC34P49427 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CDC34P49427 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CDC34P49427 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms