Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC11A1P49279 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC11A1P49279 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms