Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGM4P49221 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGM4P49221 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGM4P49221 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGM4P49221 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TGM4P49221 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TGM4P49221 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM4P49221 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM4P49221 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM4P49221 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM4P49221 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM4P49221 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGM4P49221 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms