Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CSNK1DP48730 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1DP48730 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms