Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NRIP1P48552 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NRIP1P48552 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms