Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PIP4K2AP48426 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms