Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TM4SF4P48230 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TM4SF4P48230 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms