Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA8P48165 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA8P48165 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA8P48165 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA8P48165 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA8P48165 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJA8P48165 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJA8P48165 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJA8P48165 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA8P48165 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA8P48165 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA8P48165 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA8P48165 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA8P48165 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA8P48165 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA8P48165 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJA8P48165 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA8P48165 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA8P48165 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA8P48165 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA8P48165 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA8P48165 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA8P48165 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJA8P48165 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJA8P48165 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJA8P48165 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GJA8P48165 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GJA8P48165 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms