Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME1P48163 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME1P48163 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME1P48163 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME1P48163 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME1P48163 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME1P48163 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME1P48163 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME1P48163 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME1P48163 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME1P48163 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME1P48163 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME1P48163 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME1P48163 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME1P48163 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME1P48163 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ME1P48163 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ME1P48163 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ME1P48163 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ME1P48163 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ME1P48163 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ME1P48163 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME1P48163 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME1P48163 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME1P48163 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME1P48163 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME1P48163 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME1P48163 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ME1P48163 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME1P48163 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME1P48163 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME1P48163 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME1P48163 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME1P48163 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ME1P48163 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms