Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL21P46778 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL21P46778 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL21P46778 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL21P46778 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL21P46778 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL21P46778 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL21P46778 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL21P46778 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL21P46778 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL21P46778 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL21P46778 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL21P46778 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL21P46778 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL21P46778 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL21P46778 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL21P46778 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL21P46778 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms