Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC1A1P43005 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms