Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTHFRP42898 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms