Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ELK3P41970 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ELK3P41970 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ELK3P41970 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ELK3P41970 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ELK3P41970 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ELK3P41970 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ELK3P41970 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ELK3P41970 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELK3P41970 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELK3P41970 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELK3P41970 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ELK3P41970 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms