Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK1P39086 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK1P39086 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms