Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ETFBP38117 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ETFBP38117 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ETFBP38117 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ETFBP38117 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETFBP38117 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETFBP38117 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ETFBP38117 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFBP38117 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFBP38117 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFBP38117 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFBP38117 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFBP38117 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFBP38117 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ETFBP38117 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ETFBP38117 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETFBP38117 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETFBP38117 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETFBP38117 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETFBP38117 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ETFBP38117 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms