Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
FDFT1P37268 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FDFT1P37268 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms