Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6P35125 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
USP6P35125 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP6P35125 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP6P35125 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP6P35125 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP6P35125 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP6P35125 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USP6P35125 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
USP6P35125 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6P35125 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6P35125 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6P35125 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6P35125 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6P35125 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6P35125 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6P35125 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6P35125 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USP6P35125 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6P35125 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6P35125 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6P35125 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6P35125 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6P35125 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6P35125 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6P35125 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6P35125 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6P35125 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
USP6P35125 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USP6P35125 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP6P35125 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP6P35125 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP6P35125 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP6P35125 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP6P35125 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USP6P35125 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USP6P35125 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP6P35125 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP6P35125 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP6P35125 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP6P35125 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USP6P35125 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP6P35125 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP6P35125 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP6P35125 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP6P35125 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP6P35125 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP6P35125 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP6P35125 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USP6P35125 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USP6P35125 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USP6P35125 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms