Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RYKP34925 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RYKP34925 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RYKP34925 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RYKP34925 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RYKP34925 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RYKP34925 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RYKP34925 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RYKP34925 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RYKP34925 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RYKP34925 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RYKP34925 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RYKP34925 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RYKP34925 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RYKP34925 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RYKP34925 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RYKP34925 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RYKP34925 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RYKP34925 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RYKP34925 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms