Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DSG3P32926 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DSG3P32926 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG3P32926 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG3P32926 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG3P32926 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG3P32926 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG3P32926 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG3P32926 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG3P32926 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG3P32926 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG3P32926 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DSG3P32926 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSG3P32926 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DSG3P32926 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DSG3P32926 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG3P32926 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG3P32926 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG3P32926 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG3P32926 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG3P32926 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG3P32926 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG3P32926 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG3P32926 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG3P32926 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms