Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PSMA4P25789 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PSMA4P25789 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms