Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMA3P25788 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMA3P25788 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMA3P25788 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMA3P25788 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA3P25788 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA3P25788 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA3P25788 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA3P25788 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA3P25788 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA3P25788 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA3P25788 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA3P25788 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA3P25788 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMA3P25788 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMA3P25788 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms