Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
YY1P25490 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
YY1P25490 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
YY1P25490 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
YY1P25490 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
YY1P25490 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
YY1P25490 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
YY1P25490 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
YY1P25490 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
YY1P25490 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
YY1P25490 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
YY1P25490 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
YY1P25490 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
YY1P25490 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YY1P25490 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YY1P25490 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
YY1P25490 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
YY1P25490 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
YY1P25490 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YY1P25490 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
YY1P25490 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YY1P25490 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YY1P25490 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YY1P25490 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
YY1P25490 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YY1P25490 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YY1P25490 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
YY1P25490 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
YY1P25490 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
YY1P25490 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YY1P25490 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
YY1P25490 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
YY1P25490 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms