Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCNE1P24864 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCNE1P24864 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms