Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCNCP24863 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCNCP24863 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNCP24863 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNCP24863 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNCP24863 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNCP24863 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNCP24863 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNCP24863 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNCP24863 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCNCP24863 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNCP24863 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCNCP24863 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCNCP24863 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCNCP24863 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNCP24863 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNCP24863 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNCP24863 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNCP24863 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCNCP24863 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCNCP24863 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCNCP24863 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms