Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAMP1P23763 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VAMP1P23763 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms