Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF4P23510 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF4P23510 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms