Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP100P23497 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP100P23497 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SP100P23497 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP100P23497 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SP100P23497 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP100P23497 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP100P23497 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP100P23497 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP100P23497 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SP100P23497 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP100P23497 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP100P23497 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SP100P23497 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP100P23497 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP100P23497 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP100P23497 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SP100P23497 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP100P23497 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SP100P23497 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP100P23497 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP100P23497 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP100P23497 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP100P23497 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP100P23497 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP100P23497 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP100P23497 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP100P23497 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SP100P23497 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SP100P23497 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SP100P23497 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SP100P23497 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SP100P23497 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP100P23497 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP100P23497 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SP100P23497 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP100P23497 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP100P23497 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP100P23497 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP100P23497 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP100P23497 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP100P23497 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SP100P23497 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms