Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HLA-DPA1P20036 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HLA-DPA1P20036 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms