Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE6AP16499 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE6AP16499 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms