Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM27P14373 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM27P14373 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms