Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD8P13378 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms