Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP3P12645 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BMP3P12645 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BMP3P12645 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BMP3P12645 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
BMP3P12645 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BMP3P12645 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BMP3P12645 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BMP3P12645 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP3P12645 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
BMP3P12645 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BMP3P12645 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP3P12645 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP3P12645 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP3P12645 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP3P12645 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP3P12645 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP3P12645 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP3P12645 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP3P12645 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms