Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CHRNB1P11230 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CHRNB1P11230 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms