Protein–RNA interactions for Protein: P11229

CHRM1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM1P11229 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRM1P11229 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRM1P11229 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM1P11229 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM1P11229 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM1P11229 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM1P11229 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM1P11229 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM1P11229 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRM1P11229 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms