Protein–RNA interactions for Protein: P11217

PYGM, Glycogen phosphorylase, muscle form, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGMP11217 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGMP11217 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGMP11217 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGMP11217 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGMP11217 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGMP11217 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGMP11217 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PYGMP11217 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PYGMP11217 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGMP11217 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGMP11217 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGMP11217 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGMP11217 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGMP11217 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGMP11217 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGMP11217 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGMP11217 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGMP11217 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGMP11217 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGMP11217 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGMP11217 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGMP11217 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGMP11217 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGMP11217 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGMP11217 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGMP11217 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGMP11217 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGMP11217 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGMP11217 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGMP11217 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGMP11217 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGMP11217 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGMP11217 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGMP11217 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGMP11217 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PYGMP11217 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PYGMP11217 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGMP11217 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGMP11217 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGMP11217 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGMP11217 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGMP11217 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PYGMP11217 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms