Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RARBP10826 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RARBP10826 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARBP10826 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARBP10826 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARBP10826 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARBP10826 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARBP10826 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RARBP10826 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARBP10826 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARBP10826 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RARBP10826 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RARBP10826 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RARBP10826 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RARBP10826 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RARBP10826 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RARBP10826 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARBP10826 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARBP10826 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARBP10826 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARBP10826 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARBP10826 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RARBP10826 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RARBP10826 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms