Protein–RNA interactions for Protein: P0CG47

UBB, Polyubiquitin-B, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBBP0CG47 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
UBBP0CG47 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
UBBP0CG47 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms