Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOP08100 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOP08100 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOP08100 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOP08100 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RHOP08100 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RHOP08100 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOP08100 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOP08100 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOP08100 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOP08100 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOP08100 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOP08100 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOP08100 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOP08100 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOP08100 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RHOP08100 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RHOP08100 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms