Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFMP07197 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFMP07197 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEFMP07197 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFMP07197 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFMP07197 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFMP07197 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFMP07197 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFMP07197 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFMP07197 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFMP07197 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NEFMP07197 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NEFMP07197 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEFMP07197 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEFMP07197 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEFMP07197 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEFMP07197 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEFMP07197 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEFMP07197 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NEFMP07197 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NEFMP07197 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFMP07197 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFMP07197 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFMP07197 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFMP07197 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFMP07197 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NEFMP07197 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NEFMP07197 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NEFMP07197 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms