Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRM2P04554 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRM2P04554 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRM2P04554 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRM2P04554 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms