Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
APOC3P02656 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC3P02656 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms