Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IGKV1-17P01599 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGKV1-17P01599 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms