Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EGFRP00533 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EGFRP00533 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EGFRP00533 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EGFRP00533 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EGFRP00533 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EGFRP00533 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EGFRP00533 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EGFRP00533 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EGFRP00533 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EGFRP00533 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EGFRP00533 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EGFRP00533 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EGFRP00533 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EGFRP00533 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EGFRP00533 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EGFRP00533 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EGFRP00533 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EGFRP00533 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
EGFRP00533 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EGFRP00533 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EGFRP00533 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFRP00533 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFRP00533 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFRP00533 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFRP00533 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFRP00533 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFRP00533 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EGFRP00533 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms