Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SCELO95171 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCELO95171 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCELO95171 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SCELO95171 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCELO95171 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
SCELO95171 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SCELO95171 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SCELO95171 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SCELO95171 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SCELO95171 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SCELO95171 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SCELO95171 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCELO95171 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCELO95171 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCELO95171 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCELO95171 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCELO95171 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCELO95171 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCELO95171 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCELO95171 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms