Protein–RNA interactions for Protein: O75781

PALM, Paralemmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMO75781 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PALMO75781 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PALMO75781 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PALMO75781 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALMO75781 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALMO75781 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALMO75781 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALMO75781 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALMO75781 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALMO75781 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALMO75781 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALMO75781 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALMO75781 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALMO75781 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALMO75781 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALMO75781 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALMO75781 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALMO75781 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALMO75781 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALMO75781 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALMO75781 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALMO75781 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PALMO75781 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PALMO75781 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PALMO75781 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALMO75781 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALMO75781 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PALMO75781 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALMO75781 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALMO75781 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALMO75781 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PALMO75781 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PALMO75781 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALMO75781 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALMO75781 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALMO75781 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALMO75781 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALMO75781 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PALMO75781 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms