Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPM3O75607 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPM3O75607 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPM3O75607 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPM3O75607 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NPM3O75607 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPM3O75607 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPM3O75607 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NPM3O75607 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NPM3O75607 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NPM3O75607 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NPM3O75607 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NPM3O75607 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NPM3O75607 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms