Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CLN5O75503 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CLN5O75503 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CLN5O75503 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN5O75503 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLN5O75503 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLN5O75503 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLN5O75503 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLN5O75503 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN5O75503 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN5O75503 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN5O75503 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN5O75503 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN5O75503 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN5O75503 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN5O75503 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN5O75503 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN5O75503 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLN5O75503 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms