Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VAMP4O75379 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VAMP4O75379 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms