Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTNND1O60716 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTNND1O60716 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms